对局最少时间限制规定为40分钟。

以下是比赛中每一局对局的建议时间限制：

• 构组赛及限制赛～50分钟
• 单淘汰的四分之一决赛或半决赛～90分钟
• 单淘汰决赛～无时间限制

以下是限制赛中的建议时间限制：

• 现开～套牌登记20分钟，套牌构组30分钟。对于在新系列发售当周周末举办的现开赛事，建议多增加15分钟套牌构组时间。对于在新系列发售当周周末举办的售前和现开赛事，建议多增加15分钟套牌构组时间。
• 轮抽～套牌登记及构组共25分钟
• 团队现开～套牌登记20分钟，套牌构组60分钟。对于在新系列发售当周周末举办的现开赛事，建议多增加15分钟套牌构组时间。
• 团队轮抽～套牌构组及登记共40分钟
• 双头巨人现开～套牌登记20分钟，套牌构组60分钟。对于在新系列发售当周周末举办的现开赛事，建议多增加15分钟套牌构组时间。
• 双头巨人轮抽～套牌构组及登记共40分钟

主审对比赛中的时间限制有最终决定权。如果比赛所使用的时间限制与这些建议有异，则须在比赛登记报名之前及进行报名登记时进行宣告。

万智牌重要比赛的时间限制可能会与上述不同。这些不同的时间限制可以在该场比赛或该系列比赛的说明资料上面找到。

在计时进行的局次中，牌手必须等待正式计时开始之后再开始进行各自的对局。

进行个人补充包轮抽时，每一次选牌的默认时间限制如下表所示：

第一包补充包之后供检视的时间为60秒。之后每次检视之时限增加30秒。

在每包补充包被放在桌面上之后，到选取第一张牌之前，有20秒的检视时间。牌手各有5秒钟的时候来进行每次的选牌。

在双头巨人补充包轮抽中，每一次选牌的默认时间限制如下表所示：

此外，在两包补充包之间，牌手们有60秒的时间来检视自己已选择的牌。